In un lontano futuro, a causa di una guerra intergalattica durata secoli, il mondo è andato in rovina: gran parte del pianeta si è trasformato in un gigantesco deserto popolato da insetti giganteschi e la popolazione del pianeta è diminuta di 4/5. A seguito di questa guerra apparve una razza di pseudo-umani, i Saado (o Third, da cui il nome della serie), estremamente più avanzati tecnologicamente e dotati del cosiddetto Space Eye, il terzo occhio, una pupilla rossa posta in mezzo alla fronte. Grazie a questa, possono controllare a distanza sistemi computerizzati e sfruttare facoltà extrasensoriali, una sorta di sesto senso, e ciò gli ha permesso di ascendere al potere e di ottenere il dominio totale del pianeta.

La protagonista è una ragazzina di nome Honoka, una spadaccina mercenaria, o una tuttofare come ama definirsi, che a pagamento accetta qualsiasi tipo di lavoro, tranne che l'assassinio. Accompaganata da Bogie, il computer superavanzato che controlla il carro armato usato da Honoka, si avventurano nel deserto a caccia di insetti. E proprio durante una notte nel deserto, Honoka incontra Iks, un giovane ragazzo, che però sembra nascondere qualcosa. E quando accetta di aiutare Iks, l'avventura ha inizio.